Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PDE6HQ13956 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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