Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms