Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4DQ08499 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4DQ08499 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms