Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms