Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETV1P50549 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETV1P50549 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ETV1P50549 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ETV1P50549 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETV1P50549 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETV1P50549 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms