Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 INTS6-AS1-208ENST00000594604 918 ntTSL 52.98□□□□□ -1.933e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 INTS6-AS1-222ENST00000601318 645 ntTSL 52.76□□□□□ -1.973e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 INTS6-AS1-202ENST00000593429 663 ntTSL 52.69□□□□□ -1.983e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 INTS6-AS1-224ENST00000602089 720 ntTSL 52.65□□□□□ -1.993e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 KRR1-205ENST00000551070 673 ntTSL 22.54□□□□□ -23e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 INTS6-AS1-227ENST00000610618 335 ntTSL 32.46□□□□□ -2.023e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 INTS6-AS1-228ENST00000626895 527 ntTSL 52.44□□□□□ -2.023e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.13e-8■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 28.7
PTBP1P26599 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 VSNL1-201ENST00000295156 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 VSNL1-202ENST00000404666 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.977e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.587e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.58e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 TROVE2-203ENST00000367444 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.678e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 TROVE2-202ENST00000367443 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.928e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 TROVE2-204ENST00000367445 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.098e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.163e-11■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 57.73□□□□□ -1.173e-11■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.478e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 MS4A3-202ENST00000358152 1516 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.356e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.096e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.136e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.436e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.516e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-209ENST00000515838 943 ntTSL 211.27□□□□□ -0.616e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.786e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.836e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.846e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.846e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-210ENST00000528039 764 ntTSL 38.78□□□□□ -16e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.336e-64■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 PTPRM-205ENST00000577827 4640 ntTSL 29.85□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 PTPRM-204ENST00000577468 701 ntTSL 33.15□□□□□ -1.919e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.053e-24■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.153e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.073e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.83e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-208ENST00000484907 1038 ntTSL 39.53□□□□□ -0.883e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-201ENST00000252457 2034 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-205ENST00000375308 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.633e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 CDC16-209ENST00000494581 614 ntTSL 33.38□□□□□ -1.873e-16■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 ZNF529-206ENST00000586458 2674 ntTSL 29.74□□□□□ -0.855e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 ZNF529-207ENST00000587286 568 ntTSL 47.82□□□□□ -1.165e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 ZNF529-203ENST00000585960 535 ntTSL 47.52□□□□□ -1.215e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 ZNF529-205ENST00000586115 587 ntTSL 47.17□□□□□ -1.265e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 ZNF529-204ENST00000585983 582 ntTSL 35.09□□□□□ -1.595e-9■■■■■ 28.6
PTBP1P26599 AC092279.1-201ENST00000594934 1864 ntTSL 211.18□□□□□ -0.624e-13■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 AC092279.1-202ENST00000597683 1966 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.774e-13■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.444e-13■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 MAP2K5-209ENST00000558392 1506 ntTSL 515.75■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 NDUFA5-208ENST00000490618 2802 ntTSL 28.71□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TNIK-215ENST00000496492 2736 ntTSL 1 (best)7.11□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 OLA1-203ENST00000392560 711 ntTSL 56.84□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TNIK-212ENST00000484051 1180 ntTSL 26.05□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TNIK-213ENST00000487846 573 ntTSL 45.99□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 MAP2K5-205ENST00000439036 429 ntTSL 35.65□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 MAP2K5-212ENST00000560591 1457 ntTSL 35.55□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 OLA1-208ENST00000462000 656 ntTSL 24.75□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 MAP2K5-210ENST00000559262 814 ntTSL 54.7□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TNIK-205ENST00000459881 583 ntTSL 32.05□□□□□ -2.083e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.566e-8■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 HBS1L-213ENST00000529169 633 ntTSL 35□□□□□ -1.618e-12■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 416.18■□□□□ 0.189e-12■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 410.41□□□□□ -0.749e-12■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 410.3□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 310.05□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.967e-7■■■■■ 28.5
PTBP1P26599 ZSCAN26-207ENST00000623276 1998 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.067e-7■■■■■ 28.5
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 222 ms