Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms