Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD55P08174 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD55P08174 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD55P08174 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD55P08174 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD55P08174 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD55P08174 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD55P08174 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD55P08174 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD55P08174 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD55P08174 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD55P08174 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD55P08174 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD55P08174 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD55P08174 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms