Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POP4O95707 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POP4O95707 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POP4O95707 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POP4O95707 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms