Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLGNO14967 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLGNO14967 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLGNO14967 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLGNO14967 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLGNO14967 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLGNO14967 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLGNO14967 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLGNO14967 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLGNO14967 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms