Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms