Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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