Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRTQ9BXP5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRRTQ9BXP5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms