Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5Q99717 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms