Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRERF1Q96PN7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRERF1Q96PN7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRERF1Q96PN7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRERF1Q96PN7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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