Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms