Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms