Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UPRTQ96BW1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms