Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN4CLQ8ND94 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN4CLQ8ND94 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms