Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms