Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN13Q6MZZ7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms