Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms