Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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