Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 217.84■□□□□ 0.454e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 216.61■□□□□ 0.254e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.157e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TXNRD1-220ENST00000529751 557 ntTSL 415.82■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-219ENST00000545091 1079 ntTSL 515.7■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-218ENST00000543877 537 ntTSL 415.5■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-214ENST00000540707 557 ntTSL 415.36■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 315.36■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-214ENST00000480194 455 ntTSL 515.24■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-12■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 414.53□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.254e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 313.38□□□□□ -0.274e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.324e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NIP7-206ENST00000565034 639 ntTSL 312.89□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.424e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 412.35□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.484e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 511.65□□□□□ -0.543e-12■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 NIP7-201ENST00000254940 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 PQLC1-209ENST00000589000 558 ntTSL 410.52□□□□□ -0.734e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ARMC6-207ENST00000535758 505 ntTSL 310.4□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.754e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TXNRD1-216ENST00000527335 786 ntTSL 510.05□□□□□ -0.84e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 TXNRD1-211ENST00000526266 577 ntTSL 49.2□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NIP7-203ENST00000562131 572 ntTSL 48.69□□□□□ -1.024e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NIP7-202ENST00000254941 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 TXNRD1-222ENST00000531689 554 ntTSL 48.22□□□□□ -1.094e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 TXNRD1-213ENST00000526580 400 ntTSL 1 (best)8.05□□□□□ -1.124e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 STARD7-203ENST00000462501 753 ntTSL 27.87□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.193e-12■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 NAPB-205ENST00000472855 1651 ntTSL 27.39□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 AC097478.1-205ENST00000507916 602 ntTSL 36.17□□□□□ -1.424e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 SRSF7-212ENST00000487773 637 ntTSL 54.27□□□□□ -1.734e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.774e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 33.35□□□□□ -1.873e-12■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 22.97□□□□□ -1.934e-9■■■■■ 31.2
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SF3B4Q15427 DMPK-213ENST00000598180 1626 ntTSL 213.31□□□□□ -0.287e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 SCYL1-209ENST00000528545 981 ntTSL 518.87■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 SCYL1-212ENST00000531601 896 ntTSL 315.12■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 ATP5B-202ENST00000547250 840 ntTSL 58.48□□□□□ -1.054e-12■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 SRGAP2-209ENST00000604247 2499 nt12.21□□□□□ -0.452e-17■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 SRGAP2-214ENST00000605476 2484 ntTSL 1 (best)9.58□□□□□ -0.882e-17■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 SRGAP2-212ENST00000604925 1013 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-17■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 CAPN1-203ENST00000525013 643 ntTSL 216.91■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 511.44□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.479e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.369e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.199e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.179e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.059e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.099e-10■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-209ENST00000421882 3416 ntTSL 58.2□□□□□ -1.13e-12■■■■■ 31.2
SF3B4Q15427 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.119e-10■■■■■ 31.2
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