Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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