Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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MKRN4PQ13434 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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MKRN4PQ13434 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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MKRN4PQ13434 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MKRN4PQ13434 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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