Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF6Q13247 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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