Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPS1Q13098 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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