Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALD1Q05682 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms