Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms