Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms