Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CT47B1P0C2W7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms