Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX5O60225 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX5O60225 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX5O60225 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX5O60225 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX5O60225 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX5O60225 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX5O60225 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX5O60225 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX5O60225 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX5O60225 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX5O60225 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX5O60225 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX5O60225 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms