Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CRXO43186 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CRXO43186 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CRXO43186 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CRXO43186 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CRXO43186 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CRXO43186 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CRXO43186 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CRXO43186 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CRXO43186 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms