Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCER2I3L3R5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms