Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms