Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms