Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms