Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPOCK3Q9BQ16 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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