Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms