Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms