Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JMJD6Q6NYC1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JMJD6Q6NYC1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms