Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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