Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8Q15843 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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