Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA1Q15788 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
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