Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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