Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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