Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIGQ13278 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIGQ13278 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIGQ13278 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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