Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms