Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDDM3BP56851 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms